Przełomowe badania przyszłością leczenia nowotworów
W przełomowym projekcie Pan-Cancer ponad tysiąc naukowców z całego świata zbudowało najdokładniejszy obraz nowotworów. Wyniki ich prac zostały opublikowane w dwóch artykułach czasopisma Nature i czterech artykułach towarzyszących w Nature Communications i Communications Biology. Przedstawiono w nich niemal ciałkowity obraz wszystkich znanych nowotworów. Studia te w przyszłości pozwolą na stosowanie zindywidualizowanego leczenia każdego pacjenta, jak również na wcześniejsze wykrywanie nowotworów.
Konsorcjum Pan-Cancer przeanalizowało kompletny kod genetyczny 2 658 nowotworów. Znaleziono 4-5 głównych mutacji, które sterują rozwojem nowotworu. Mutacje te mogą być celem terapii antynowotworowych, w szczególności indywidualnie dostosowanych do każdego pacjenta. Szczególną uwagę w projekcie poświęcono obszarom niekodującym białka, występującym w elementach regulatorowych genomu.
Dzięki określeniu wieku mutacji (około 20% tych mutacji powstaje wiele lat, a nawet dziesięcioleci wcześniej) powstają nowe możliwości wczesnego diagnozowania, nawet zanim nowotwór powstanie.
Nasz pracownik, profesor Jan Komorowski, uczestniczy w projekcie Pan-Cancer i jest współautorem wspomnianych sześciu artykułów. Wkład jego zespołu w projekt Pan-Cancer to przede wszystkim wykrywanie istotnych mutacji w obszarach regulatorowych genomów.
Rheinbay, E., Nielsen, M.M., Abascal, F. et al. Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes. Nature 578, 102–111 (2020). doi: 10.1038/s41586-020-1965-x,
Campbell, P.J., Getz, G., Korbel, J.O. et al. Pan-cancer analysis of whole genomes. Nature 578, 82–93 (2020). doi: 10.1038/s41586-020-1969-6,
Carlevaro-Fita, J., Lanzós, A., Feuerbach, L. et al. Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis. Commun Biol 3, 56 (2020). doi: 10.1038/s42003-019-0741-7,
Reyna, M.A., Haan, D., Paczkowska, M. et al. Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes. Nat Commun 11, 729 (2020). doi: 10.1038/s41467-020-14367-0,
Paczkowska, M., Barenboim, J., Sintupisut, N. et al. Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data. Nat Commun 11, 735 (2020). doi: 10.1038/s41467-019-13983-9,
Shuai, S., Abascal, F., Amin, S.B. et al. Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower. Nat Commun 11, 734 (2020). doi: 10.1038/s41467-019-13929-1
